Python

生信流程全自动化方案

分享一下当前接触和应用的生信流程自动化分析的实现 经验一 前言 19年底刚到厦门的时候,接触了一家跟临床医院合作,提供罕见病基因检测服务的公司,生信主要对二代 DNA 杂交捕获的测序数据进行分析,人工操作步骤大致如下: 拿到实验室做好的样本信息 待测序公司返回数据后,需要第一时间进行 fq 数据的下载 根据样本分析类型,拷贝对应的 demo 分析流程 根据样本的实际信息,修改分析流程中对应的参数

Django进阶之路由层和视图层

Django的路由系统 【1】什么是URL配置(URLconf) URL调度器 | Django 文档 | Django (djangoproject.com) URL配置(URLconf)就像Django 所支撑网站的目录。 它的本质是URL与要为该URL调用的视图函数之间的映射表。 你就是以这种方式告诉Django,对于这个URL调用这段代码,对于那个URL调用那段代码。 【2】基本

小工具icmpsh的基本操作

小工具icmpsh的基本操作 基础介绍 原理:通过icmp这个协议进行反弹一个shell 前提条件:Kali(192.168.126.134)与Windows7(192.168.126.129)靶机需要在同一个网段(内网)当中,可以进行通信 操作流程 1、github上下载资源,复制进Kali,进行解压 GitHub - bdamele/icmpsh: Simple reverse ICMP sh

PSP设计文档

PSP 为熟悉软件开发流程,个人项目使用文档记录 设计文档的书写 计划 初步计划使用熟悉的语言进行编程,开始使用C语言进行构思,调试无果,改用面向对象语言Python进行开发 开发 需求分析 功能需求:用户需求为比较两个文档的相似度,提供接口接受两个待处理文件,传回一个结果目标文件 开发环境:确定为python3进行开发,使用版本为python3.10.0 产品功能:默认一种方法,

Python简单实现查重

使用Python实现查重 这个作业属于哪个课程 软件工程 这个作业要求在哪里 个人项目 这个作业的目标 初步认识软件开发流程,独立培养开发能力,熟悉PSP记录开发过程 你可以在GitHub上找到本项目并下载额外三种算法代码 Slave 前言 作为开发人员,不幸的是此前未曾接触熟悉过Python语言,本次开发即第一次实战,在使用C语言进行开发途中遇到许多问题,调试无果,遂改

vs2019单独重新安装python37_64失败解决办法(bilibili上那个也是我,现在开始用博客园写这些博客)

上个周末的时候,我发现用vs2019编写python的时候。代码高亮出现了奇怪的问题,进入解决方案的时候,print还是蓝色的,但是过了几秒钟后就变为黑色了,因此在最开始的时候我试图通过换一个皮肤和在管理扩展里面找扩展来解决,但是还是有相关问题。于是到vs2019对应的python文件夹找问题,目录是F:Program Files (x86)Microsoft Visual StudioShare

windows上python3开发环境的搭建

首先进入python官网(当然 我们这里所说的python指的是python3,因为如今python2已经停止更新 更多的python开发者也会选择python3,这篇博客也是python3环境的搭建) Python 官网:https://www.python.org/ 选择windows版本,我们作为python入门者选择最新版截至目前3.12.2为最新版,点击download下面的window

3-10博客

今天完成了第一次数据筛查作业 用idea清洗数据,用python完成分析  

民科技术速记

垃圾萌新,因为要用到一些东西所以现学,随手记录一下 内容可能有点勾史 Redis Ref:https://zhuanlan.zhihu.com/p/469102289 Remote Dictionary Server / 远程字典服务,开源软件 基于内存的 key-value 的 NOSQL 数据库 首先想办法安装。以下假如安装目录是 /etc/redis: /etc/redis/bin 里是

LeetCode 128.最长连续序列 Python题解

leetcode 128题 最长连续序列 分享解题思路,使用哈希表算法 🔹题目给定一个未排序的整数数组nums,找出数字连续的最长序列(不要求序列元素在原数组中连续)的长度🔹设计时间复杂度为O(n)的算法解决问题🔹示例1给定数组[100,4,200,1,3,2],最长的连续序列是 [1,2,3,4],最长序列长度为4。 🔸解题思路1.创建一个 Set数据结构numsSetset可以去重避免排序时有

CYQ.Data 支持 KingbaseES人大金仓数据库

KingbaseES人大金仓数据库介绍: KingbaseES是一种关系型数据库管理系统,也被称为人大金仓数据库。KingbaseES 是北京人大金仓信息技术股份有限公司研发的,具有自主知识产权的通用数据库产品。 该产品面向事务处理类应用,兼顾各类数据分析类应用,可用做管理信息系统、业务及生产系统、决策支持系统、多维数据分析、全文检索、地理信息系统、图片搜索等的承载数据库。 作为KingbaseE

153. 寻找旋转排序数组中的最小值(中)

目录题目题解:二分 题目 已知一个长度为 n 的数组,预先按照升序排列,经由 1 到 n 次 旋转 后,得到输入数组。例如,原数组 nums = [0,1,2,4,5,6,7] 在变化后可能得到: 若旋转 4 次,则可以得到 [4,5,6,7,0,1,2] 若旋转 7 次,则可以得到 [0,1,2,4,5,6,7] 注意,数组 [a[0], a[1], a[2], ..., a[n-1]] 旋转

PyCharm依赖包导入导出方法,以及各种镜像源

    各种源 - 清华:https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple- 阿里云:http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/- 中国科技大学 :https://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/- 豆瓣:http://pypi.douban.com/simple/

Asyncio in Python and Concurrency tasks

Asyncio Library and Concurrency tasks in Python The asyncio library is a Python standard library module used for writing single-threaded concurrent code using coroutines, multiplexing I/O access, and

告别os.path,拥抱pathlib

pathlib 模块是在Python3.4版本中首次被引入到标准库中的,作为一个可选模块。从Python3.6开始,内置的 open 函数以及 os 、 shutil 和 os.path 模块中的各种函数都可以正确地使用 pathlib.Path 对象了。 最初,pathlib给人的感觉只是os.path的一个不必要的面向对象版本,不过,当你实际去了解pathlib之后,会发现pathlib实际上

无线表格识别模型LORE转换库:ConvertLOREToONNX

引言 总有小伙伴问到阿里的无线表格识别模型是如何转换为ONNX格式的。这个说来有些惭愧,现有的ONNX模型是很久之前转换的了,转换环境已经丢失,且没有做任何笔记。 今天下定决心再次尝试转换,庆幸的是转换成功了。于是有了转换笔记:ConvertLOREToONNX。 这次吸取教训,环境文件采用Anaconda导出的,更加详细记录当前转换环境。以下是转换仓库的README,感兴趣小伙伴可以点击文末的“

数据清洗Anaconda安装教程

Anaconda超详细安装教程(Windows环境下)_conda安装-CSDN博客 【B站强推!2023公认最通俗易懂的【数据分析】教程,200集付费课程(附数据集)Excel_SQL_Python_统计学__数学建模-哔哩哔哩】 https://b23.tv/8Q4YLG8

kubernetes快速入门之K3S

kubernetes简介 Kubernetes 是一个开源的容器编排引擎和容器集群管理工具,用来对容器化应用进行自动化部署、 扩缩和管理。 Kubernetes 这个名字源于希腊语,意为“舵手”或“飞行员”。k8s 这个缩写是因为 k 和 s 之间有8个字符。 Google 在 2014 年开源了 Kubernetes 项目。 优势 Kubernetes 建立在 Google 大规模运行生产工作

群星璀璨的Python江湖,Python第三方库介绍

如果Python语言是一个江湖,那么python第三方库就是一个个身怀绝技的江湖侠客,这些侠客在这偌大的江湖尽情挥洒着江湖侠气。有人名扬天下,有人默默无闻,有人纵横捭阖,有人黯然谢幕,每天都在上演人生的悲欢离合。 那么什么是python第三方库呢? 什么是python第三方库 python是一门非常流行的语言,其中python语言本身就提供了非常多简单、易用的接口,但毕竟不能顾及到方方面面,很多

mavlink wireshark调试

mavlink wireshark调试 生成wireshark插件 在mavlink generator工程下,执行如下shell语句,生成wireshark 插件(lua脚本文件) 其中,--output 指定生成的插件名称;其后带mavlink xml文件(如上为common.xml) 修改wireshark插件 在生成的lua脚本中最下几行,修改mavlink协议对应的传输层协议和端口号(

Assistants API

Assistants API 允许您在自己的应用程序中构建 AI 助手。助手有指令,可以利用模型、工具和知识来响应用户查询。Assistants API 目前支持三种类型的工具:代码解释器、检索和函数调用。未来,我们计划发布更多 OpenAI 构建的工具,并允许您在我们的平台上提供自己的工具。 您可以使用Assistants Playground或通过构建本指南中概述的分步集成来探索 Assist

anaconda创建虚拟环境

1. anaconda创建虚拟环境 创建 conda create -n environment_name python=X.X 激活 conda activate xxx 命令行和解释器都切换到HotEvent

MIT 6.858 计算机系统安全讲义 2014 秋季(一)

译者:飞龙 协议:CC BY-NC-SA 4.0 MIT 6.858 计算机系统安全笔记 2014 秋季 2014 年由Nickolai Zeldovich 教授和James Mickens 教授教授授课的 6.858 讲座笔记。这些讲座笔记略有修改,与 6.858 课程网站上发布的内容略有不同。 第1讲:介绍:什么是安全,意义何在,没有完美的安全,策略,威胁模型,假设,机制,缓冲区溢出

MIT 6.858 计算机系统安全讲义 2014 秋季(二)

译者:飞龙 协议:CC BY-NC-SA 4.0 本地客户端 注意: 这些讲座笔记略有修改,来自 2014 年 6.858 课程网站。 本文的目标是什么? 当时,浏览器只允许任何网页运行 JS(+Flash)代码。 希望允许 Web 应用程序在用户的计算机上运行本机(例如,x86)代码。 不想在服务器上运行复杂代码。 需要大量服务器资源,为用户带来高延迟。 这有什么用?

MIT 6.858 计算机系统安全讲义 2014 秋季(三)

译者:飞龙 协议:CC BY-NC-SA 4.0 SSL/TLS 和 HTTPS 注意:这些讲座笔记略有修改自 2014 年 6.858 课程网站上发布的笔记。 这节课涉及两个相关主题: 如何在比 Kerberos 更大规模上加密保护网络通信? 技术:证书 如何将网络流量的加密保护整合到 Web 安全模型中? HTTPS,安全 cookie 等。 对称与非对称加密 回顾:两

Bad magic number for central directory

Bad magic number for central directory 运行代码输出如下bug: 背景: 尝试把多个进程的运行结果写入到同一个excel表格的不同sheet中。 解决方法: 写如不同的excel表格中。

去除多个不同的字符或特殊字符

python字符串一次替换多个字符使用replace替换多处_python replace只替换第二个-CSDN博客 pandas处理文本特征之特殊字符剔除_pandas删除特定字符-CSDN博客 大写w表示去除特殊字符 小写w表示匹配特殊字符  

Python scapy模拟dhcp客户端

安装scapy apt install -y python3-scapy 1. 发送dhcp discover广播报文2. sniff抓包,收到dhcp offer广播报文(可能来自多个dhcp服务端)3. 向1个dhcp服务端发送dhcp request广播报文4. sniff抓包,收到dhcp ack广播报文 import threading from scapy.all import * f

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