conda环境下安装pysctransform
要在 Conda 环境中安装一个程序的软件包，可以按照以下步骤进行操作。这里的步骤包括克隆 GitHub 仓库，安装所需的 Python 包，并最终安装 pySCTransform。
1. 创建并激活一个新的 Conda 环境
首先，创建并激活一个新的 Conda 环境以避免影响到其他项目：
conda create --name pysc_env python=3.9
conda activate pysc_env
2. 克隆仓库
使用 Git 克隆仓库：
git clone https://github.com/saketkc/pySCTransform.git
网络问题可能下载缓慢或者下载失败 尝试本地下载压缩包后 上传到服务器然后解压
unzip develop.zip
3. 进入仓库目录
进入刚刚克隆的仓库目录：
cd pySCTransform-develop
4. 安装所需的 Python 包
在 Conda 环境中使用 pip 来安装仓库中的依赖包：
pip install -r requirements.txt
如果你想确保所有依赖包都安装在 Conda 管理的环境中，也可以尝试使用 Conda 来安装依赖包（需要手动逐个包地安装）：
# 手动安装每个依赖包
conda install <package_name>
5. 安装 pySCTransform
最后，安装 pySCTransform：
pip install .
6. 验证pySCTransform
确认 pySCTransform 是否已成功安装以及其版本信息：
pip show pysctransform