通路
在宏基因组个性化分析中，通路（Pathway）指的是一组相互关联且在生物体内共同执行某种生物学功能的基因或代谢物的集合。通路可以被看作是特定功能的生物学模块，其中的基因或代谢物相互作用并共同参与特定的生物过程。
通路的定义可以基于不同的层次和维度。在基因层面上，通路可以是一组相互作用的基因，这些基因在特定的信号转导或代谢途径中参与。在代谢物层面上，通路可以是一组通过代谢反应相互关联的化合物。通路的定义也可以考虑到功能模块之间的相互作用和调控关系。
在宏基因组个性化分析中，通路分析可以帮助我们理解和解释微生物群落的功能特征。通过对宏基因组数据进行通路分析，可以揭示微生物群落中不同通路的丰度和活性，从而推断其可能的生物学功能。通路分析可以用于研究微生物群落的代谢能力、营养互作关系、环境适应性等方面的特征。
常用的宏基因组通路分析方法包括KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）通路分析、MetaCyc通路分析等。这些方法通过将宏基因组数据中的序列与已知通路数据库进行比对和注释，来推断微生物群落中不同通路的存在和功能。